Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Etv4P28322 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Etv4P28322 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms