Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LoxP28301 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LoxP28301 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LoxP28301 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LoxP28301 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LoxP28301 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LoxP28301 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LoxP28301 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LoxP28301 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms