Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-DMaP28078 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms