Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnd1P25322 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms