Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk11bP24788 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk11bP24788 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms