Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gria1P23818 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms