Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd11P23813 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd11P23813 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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