Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja1P23242 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms