Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tap1P21958 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms