Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcer1aP20489 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms