Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VimP20152 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VimP20152 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VimP20152 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VimP20152 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VimP20152 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VimP20152 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VimP20152 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VimP20152 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VimP20152 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VimP20152 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VimP20152 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VimP20152 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VimP20152 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VimP20152 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VimP20152 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VimP20152 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VimP20152 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms