Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms