Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms