Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Selenbp1P17563 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms