Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spi1P17433 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms