Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f1P17208 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f1P17208 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms