Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctla2aP12399 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctla2aP12399 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms