Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06344 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06344 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06344 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06344 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P06344 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06344 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06344 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06344 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06344 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06344 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06344 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06344 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06344 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06344 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06344 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
P06344 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06344 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms