Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P06335 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P06335 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06335 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06335 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06335 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06335 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06335 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06335 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06335 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06335 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms