Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P06323 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P06323 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06323 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06323 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06323 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06323 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06323 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06323 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06323 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06323 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06323 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06323 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms