Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ItgamP05555 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms