Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa2P05367 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms