Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms