Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tgfb1P04202 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tgfb1P04202 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfb1P04202 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tgfb1P04202 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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