Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-AaP01910 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-AaP01910 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms