Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01740 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01740 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01740 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01740 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01740 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01740 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01740 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01740 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01740 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms