Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccl20O89093 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccl20O89093 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccl20O89093 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccl20O89093 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccl20O89093 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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