Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Setdb1O88974 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Setdb1O88974 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms