Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cops6O88545 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cops6O88545 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops6O88545 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cops6O88545 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops6O88545 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops6O88545 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cops6O88545 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms