Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AurkcO88445 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AurkcO88445 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms