Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfdp1O88271 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cfdp1O88271 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cfdp1O88271 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms