Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfi1bO70237 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfi1bO70237 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms