Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna4O70174 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms