Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChadO55226 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChadO55226 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChadO55226 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChadO55226 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ChadO55226 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ChadO55226 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChadO55226 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ChadO55226 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChadO55226 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChadO55226 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChadO55226 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChadO55226 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ChadO55226 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ChadO55226 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChadO55226 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms