Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp2a2O55143 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp2a2O55143 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms