Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl35aO55142 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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