Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap2O55126 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap2O55126 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms