Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg2O55111 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg2O55111 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms