Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syngr1O55100 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms