Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl13O55038 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms