Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc3O55013 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms