Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjd2O54851 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjd2O54851 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjd2O54851 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms