Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CrxO54751 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxO54751 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CrxO54751 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CrxO54751 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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