Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppfibp2O35711 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms