Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe40O35185 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe40O35185 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms