Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcns1O35173 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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