Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarb2O35114 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scarb2O35114 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms