Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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H2-Q1O19441 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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H2-Q1O19441 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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H2-Q1O19441 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Q1O19441 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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H2-Q1O19441 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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H2-Q1O19441 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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H2-Q1O19441 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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H2-Q1O19441 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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H2-Q1O19441 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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H2-Q1O19441 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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H2-Q1O19441 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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H2-Q1O19441 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Q1O19441 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms