Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casq1O09165 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casq1O09165 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casq1O09165 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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