Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sypl1O09117 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sypl1O09117 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sypl1O09117 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sypl1O09117 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sypl1O09117 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sypl1O09117 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sypl1O09117 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sypl1O09117 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sypl1O09117 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms